Yo tuve una experiencia similar, con la diferencia de que reinstalé una imágen del W98 que fué creada antes de instalar el Xp, el resultado fué de que solo podía iniciar el W98, por que no tenía los archivos de booteo para el Xp.
Lo que hice fué lo siguiente, primero creé una imágen Ghost de la partición del Xp (F), seguidamente formateé dicha partición y volví a instalar el Xp . pero solo lo básico, nada de drivers ni peor acualizaciones, de esta manera el instalador del Xp colocó todos los archivos necesarios en la partición del W98 (C), por último, reinstalé la imágen creada del Xp en (F).
Si lo anterior no da resultado, primero instala el W98en (C) , luego el Xp en ( F) y finalmente reintala la imágen del Xp nuevamente en (F), esta alternativa es segurísimo que funciona, pero tiene la contra de que tendrías nuevamente el W98, por lo que sería motivo de otra historia la forma de eliminar en forma segura el w98.
