Acabo de leer esto y mi pregunta es si se puede hacer o trae algun problema?
Casi todos hemos pasado alguna vez por ello y sabemos el riesgo de datos que ello supone.
Con el tiempo Windows comienza a perder estabilidad, de hecho y si mantenemos el sistema instalado durante más de 2 años lo normal es que este se encuentre bastante deteriorado.
La práctica habitual consiste en borrar completamente el sistema, formateando el disco duro y proceder a instalar Windows desde cero.
Una práctica que puede ser evitada, dado que en realidad lo único que necesitaremos reinstalar es el directorio Windows.
A continuación una completísima guía detallada por sistema operativo en la que se nos enseña a reinstalar Windows sin perder los datos.
Una lectura más que constructiva, aunque lamentablemente en Inglés.
http://www.pcworld.com/howto/article/0,aid,111652,pg,1,00.asp